Węże silikonowe dopuszczone do kontaktu z żywnością generalnie nie zaleca się bezpośredniego kontaktu ze środkami dezynfekcyjnymi. Chociaż rurki silikonowe tolerują w niektórych przypadkach niektóre chemikalia, środki dezynfekcyjne często zawierają silne utleniacze, chlorki, alkohole lub inne żrące i reaktywne składniki chemiczne, które mogą reagować z żelem silikonowym, powodując korozję powierzchni, twardnienie, odbarwienie lub pogorszenie wydajności rurki silikonowej.
Na przykład, chociaż reakcja pomiędzy wodorotlenkiem sodu a żelem silikonowym jest stosunkowo łagodna w temperaturze pokojowej, w wysokich temperaturach może ulec gwałtownej reakcji, wpływając na działanie rurek silikonowych. Podobnie środki dezynfekcyjne zawierające chlor, takie jak podchloryn sodu, mają silne właściwości utleniające i mogą uszkodzić strukturę chemiczną żelu krzemionkowego. Chociaż alkoholowe środki dezynfekcyjne są mniej drażniące, długotrwałe narażenie może również mieć niekorzystny wpływ na żel silikonowy.
